Der Hauptzweck der Vereinigung ist die Förderung, Organisation, Verwaltung und Durchführung von systematischen Krebsfrüherkennungsprogrammen in den Kantonen Jura, Neuenburg und Bern für seinen Verwaltungsbezirk Berner Jura, die sich an die dort ansässigen Bevölkerungsgruppen richten, die von solchen Programmen erfasst werden.

Die Vereinigung handelt im gemeinsamen oder besonderen Auftrag der Kantone Jura, Neuenburg und Bern, nach Krebsart.

Die Vereinigung kann auch andere spezifische Aufgaben übernehmen, die in ihren Kompetenzbereich fallen, auf besonderen Auftrag von anderen Organisationen, die im BEJUNE-Raum tätig sind.